Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu
Katedra Genetyki
ul. Kożuchowska 7, 51-631 Wrocław
prof. dr hab. inż. Joanna Szyda
tel. (071) 320 5846
e-mail: joanna.szyda@upwr.edu.pl
Tematy badawcze
- Modelowanie statystyczne cech o zmienności ilościowej i binarnej;
- Bioinformatyczne przetwarzanie dużych zbiorów danych z populacji ludzi i zwierząt;
- Wykorzystanie ogólnodostępnych narzędzi programistycznych do bioinformatycznego modelowania danych biologicznych;
- Zastosowanie własnych programów do bioinformatycznego modelowania danych biologicznych;
- Rozwój metodyki statystycznej w zastosowaniu do wielkoskalowych danych biologicznych;
- Rozwój metod obliczeniowych stosowanych do wielkoskalowych danych biologicznych;
- Wykorzystanie potoków bioinformatycznych do przetwarzania danych multiomicznych: DNAseq, RNAseq, RRBSseq, ATACseq oraz danych metagenomicznych;
- Modelowanie statystyczne danych multiomicznych: DNAseq, RNAseq, RRBSseq, ATACseq, dane metagenomiczne, dane bioobrazowania;
- Ocena genetyczna i genomiczna zwierząt hodowlanych;
- Badania asocjacyjne całych genomów.;
- Zastosowanie technik sztucznej inteligencji do przewidywania i klasyfikacji próbek biologicznych w danych wielowymiarowych;
- Wyjaśnialność modeli AI;
- Modelowanie danych powtarzalnych w czasie;
- Modelowanie statystyczne biologicznych adnotacji funkcjonalnych;
- Analiza przeżycia;
- Wykrywanie punktowych i strukturalnych wariantów DNA.
Słowa kluczowe: sztuczna inteligencja, big data w biologii, bioinformatyka, biostatystyka, programowanie komputerowe, statystyka kliniczna, biologia obliczeniowa, ocena genetyczna, epidemiologia genetyczna, genomika, obliczenia o wysokiej wydajności, dane powtarzalne w czasie, warianty polimorficzne, genetyka statystyczna, modelowanie statystyczne, analiza przeżycia
